¶ Aperçu du cas d'usage
Le jumeau numérique du sol permettra de modéliser les caractéristiques physiques, chimiques et biologiques des sols exploitations agricoles pour améliorer la gestion agroécologique des pratiques agricoles. Il permettra de prédire la fertilité et les fonctions écologiques à partir de données physiques, biologiques et climatiques. Il accompagne les pratiques agricoles durables et éclaire les politiques de gestion durable des terres.
Le jeu témoin déposé porte sur 60 échantillons de sol prélevés sur 12 parcelles de cinq sites normands, répartis en quatre modalités de conduite. Il associe des indicateurs de laboratoire et des spectres proche infrarouge acquis à treize ans d'intervalle.
¶ Données disponibles
Le régime d'accès à ces quatre fichiers n'est pas encore arrêté. Ils sont décrits ici pour que leur contenu soit connu ; les modalités de mise à disposition restent à définir avec UniLaSalle.
| Identifiant | Jeu de données | Type | Période couverte | Conditions d'accès | Emplacement | Date de mise à disposition | Commentaires |
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Caractéristiques des parcelles | CSV | sans objet | en attente | UniLaSalle | 25/11/2025 | 60 échantillons, 12 parcelles, 5 sites | |
| Indicateurs physico-chimiques et biologiques | CSV | sans objet | en attente | UniLaSalle | 25/11/2025 | 21 indicateurs ; unités non fournies | |
| Spectres proche infrarouge 2012 | CSV | 2012 | en attente | UniLaSalle | 25/11/2025 | 1 500 bandes, 60 échantillons | |
| Spectres proche infrarouge 2025 | CSV | 2025 | en attente | UniLaSalle | 25/11/2025 | mêmes 60 échantillons qu'en 2012 |
¶ Détail par jeu de données
¶ Caractéristiques des parcelles
- Variables : modalité de conduite (
Land.use.method), site, parcelle, identifiant d'échantillon - Pas de temps : sans objet
- Période couverte : sans objet
- Format : CSV, séparateur point-virgule, 60 lignes
- Conditions d'accès : le régime d'accès n'est pas encore arrêté ; s'adresser à UniLaSalle
C'est la table de rattachement des 60 échantillons : elle donne, pour chacun, la parcelle, le site et la modalité de conduite. Les identifiants d'échantillon sont les mêmes que dans les trois autres fichiers, et les 60 sont présents dans chacun.
Quatre modalités de conduite, 15 échantillons chacune : agriculture biologique, agriculture intégrée, agriculture intégrée avec travail du sol, agriculture conventionnelle.
Cinq sites, 12 parcelles : Guitry, Richeville et Tourny (15 échantillons chacun), Sacquenville (10), Combon (5).
¶ Indicateurs physico-chimiques et biologiques
- Variables : 21 indicateurs pour chaque échantillon
- physico-chimie : carbone total et organique, azote, rapport C/N, pH, pH KCl, CEC, P₂O₅
- biomasse fongique : ergostérol total, libre et lié
- biologie moléculaire : ADN total, 18S (fongique), 16S (bactérien)
- activités enzymatiques : β-glucosidase, cellulase, NAG, xylanase
- activité microbienne : Biolog PP, Biolog AWCD, respiration
- Pas de temps : sans objet — une mesure par échantillon
- Période couverte : sans objet — la date de prélèvement n'est pas portée par le fichier
- Format : CSV, 60 lignes, 22 colonnes
- Conditions d'accès : le régime d'accès n'est pas encore arrêté ; s'adresser à UniLaSalle
Deux particularités de format à connaître avant de lire le fichier :
- La virgule y sert à la fois de séparateur de colonnes et de séparateur décimal. 795 des 1 260 valeurs sont donc encadrées de guillemets, sous la forme
"0.0,20". La convention permettant de les relire n'est pas fournie avec le dépôt. - Les 60 valeurs de la colonne
18sportent un suffixes(55000000s), qui empêche leur lecture directe comme nombres.
Les unités ne sont pas documentées. Il n'y a pas de dictionnaire de variables joint au dépôt.
¶ Spectres proche infrarouge 2012
- Variables : identifiant d'échantillon, puis 1 500 bandes numérotées de 1001 à 2500
- Pas de temps : campagne unique
- Période couverte : 2012
- Format : CSV, séparateur point-virgule, 60 lignes × 1 501 colonnes
- Conditions d'accès : le régime d'accès n'est pas encore arrêté ; s'adresser à UniLaSalle
Une valeur par bande et par échantillon, comprise entre 0,44 et 0,64 (moyenne 0,51).
¶ Spectres proche infrarouge 2025
- Variables : identiques à la campagne 2012 — 1 500 bandes numérotées de 1001 à 2500
- Pas de temps : campagne unique
- Période couverte : 2025
- Format : CSV, séparateur point-virgule, 60 lignes × 1 501 colonnes
- Conditions d'accès : le régime d'accès n'est pas encore arrêté ; s'adresser à UniLaSalle
Les valeurs s'étendent de 0,42 à 0,77 (moyenne 0,57).
Les 60 échantillons sont exactement les mêmes qu'en 2012, ce qui donne deux acquisitions du même ensemble à treize ans d'intervalle.
¶ Ce qui reste à obtenir
- Dictionnaire des variables d'indicateurs — unités, méthode de mesure, seuils de quantification. Rien n'accompagne aujourd'hui les 21 indicateurs.
- Convention de lecture du fichier d'indicateurs — ou une version au format à séparateur décimal explicite.
- Dates et protocole de prélèvement — les fichiers ne portent ni la date des prélèvements, ni la profondeur, ni le protocole d'échantillonnage.
- Bases de données pédologiques et climatiques mobilisables — RMQS, BDAT, LUCAS Soil, SAFRAN, AgERA5 sont identifiées ; la liste reste à finaliser, avec les liens d'accès.
- Modèles mobilisables — liste à finaliser.
- Mesures physiques disponibles sur cultures types — notamment celles envisagées pour l'instrumentation de la preuve de concept en Normandie.
¶ État d'avancement (septembre 2026)
Un jeu témoin de 60 échantillons est déposé sur le Nextcloud du projet : caractéristiques des parcelles, 21 indicateurs physico-chimiques et biologiques, et deux campagnes de spectres proche infrarouge (2012 et 2025) sur les mêmes échantillons.
Le cas d'usage s'appuie sur une approche hybride combinant modèles mécanistes et modèles data-driven, avec l'objectif d'un jumeau numérique du sol intégrant des données dynamiques en quasi temps réel. Une preuve de concept est envisagée en Normandie sur des cultures d'orge et de colza, avec pour objectif final un outil d'aide à la décision permettant de simuler des scénarios de conduite.
Les prochaines étapes consistent à finaliser la liste des bases de données et des modèles mobilisables, ainsi que les types de mesures physiques disponibles sur les cultures types.